Bases de données disponibles sur Evry (bio-informatique)

Le campus de Genopole® met à la disposition de la communauté scientifique d'importantes bases de données.

Centre national de génotypage, CNG

Diverses techniques et outils associés au génotypage sont disponibles au CNG : des banques d'ADN, des marqueurs et cartes génétiques, des outils pour la cartographie physique et le clonage des gènes, l'analyse statistique, l'épidémiologie génétique et la bioinformatique, etc.

Centre national de séquençage, CNS

• Banques de séquence
  
• Outils biologiques proposés par le CNS :
  
  • Serveur BLAST
    
  • Utilisation du 'WORKING DRAFT' du génome humain pour le clonage positionnel
  
  

Infobiogen

Le serveur d'Infobiogen propose un certain nombre de traitements classiques dans le domaine de la bioinformatique, tant sur des séquences personnelles que sur les séquences de banques : traduction, carte de restriction, recherche de motifs, recherche de similitudes et alignements locaux, alignements globaux, conversion de formats.

• Bases de données mises à disposition des chercheurs et entrepreneurs
• Interrogation simple ou croisée sur un éventail large de bases en biologie moléculaire : SRS (Sequence Retrieval System);
• Interrogation des données de la Protein Data Bank : PDBBrowse ;
• Base de donnée sur les maladies rares et les médicaments orphelins. Son objectif est d'optimiser l'utilisation des informations disponibles sur les maladies rares pour améliorer le diagnostic, le traitement et la prise en charge des malades et faire progresser la recherche. Liens avec les banques OMIM, GENDIAG et Thériaque : ORPHANET ;
• Base de données sur les syndromes génétiques et les anomalies du développement chez l'homme : GENDIAG ;
• Atlas génétique et cytogénétique de données oncologiques et hématologiques (chez l'Homme). Celles-ci sont issues d'études génétiques et cliniques sur les cancers : Chromosome_cancer.

Catalogues

• Catalogue des bases de données publiques en biologie : DBCAT ;
• Catalogue des thèses en bioinformatique en France : DBthèse ;
• Catalogue des logiciels et bases de données produits en France : DBLOGfr.

Pour en savoir plus :

- Consulter le site du CNG : http://www.cng.fr

- Consulter le site du CNS : http://www.cns.fr

- Consulter le site d'Infobiogen. : http://www.infobiogen.fr