2011

Un consortium de chercheurs associant le Genoscope (CEA/Evry), le CNRS, l’IRD et les Universités de Strasbourg, de Montpellier, d’Evry Val d’Essonne et de Pau, vient de révéler la diversité métabolique des principaux microorganismes présents dans un effluent résultant de l’exploitation d’une mine fortement contaminé par l’arsenic.
En analysant l’ensemble des gènes d’une population bactérienne, ils ont mis en évidence plusieurs capacités microbiennes comme le métabolisme des nutriments organiques, des acides aminés et des vitamines ou comme l’oxydation du fer, du soufre et de l’arsenic. Ils ont également montré que les bactéries mutualisaient ces fonctions.
Une analyse statistique des données génomiques et protéomiques et des expériences de RT-PCR ont permis aux scientifiques de construire un modèle intégré des interactions métaboliques qui peuvent être d’une importance capitale pour remédier naturellement aux transformations menées par l’Homme sur ces écosystèmes.

Référence : Metabolic diversity among main microorganisms inside an arsenic-rich ecosystem revealed by meta- and proteo-genomics. Philippe N Bertin, Audrey Heinrich-Salmeron, Eric Pelletier, Florence Goulhen-Chollet, Florence Arsène-Ploetze, Sébastien Gallien, Béatrice Lauga, Corinne Casiot, Alexandra Calteau, David Vallenet, Violaine Bonnefoy, Odile Bruneel, Béatrice Chane-Woon-Ming, Jessica Cleiss-Arnold, Robert Duran, Françoise Elbaz-Poulichet, Nuria Fonknechten, Ludovic Giloteaux, David Halter, Sandrine Koechler, Marie Marchal, Damien Mornico, Christine Schaeffer, Adam Alexander Thil Smith, Alain Van Dorsselaer, Jean Weissenbach, Claudine Médigue and Denis Le Paslier. The ISME Journal (2011) 5, 1735–1747

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